Siden den excentriske dyrlæge dr. John Dolittle mistede sin kone for år tilbage, har han boet afsides og forskanset i sit palæ med alle sine eksotiske dyr, som han er i stand til at kommunikere med. Han hidkaldes en dag til den unge Dronning Victorias hof, da hun ligger dødeligt syg, og Dolittle beordres til at finde en kur, hvilket bringer ham ud på en farefuld ekspedition til en mystisk ø.